Die Formatentwicklung am Tieranatomischen Theater findet im Kontext einer Vielzahl von Institutionen übergreifenden und transdisziplinären Kooperationen statt. Seit 2013 entstanden Ausstellungen, Aufführungen und Veranstaltungsreihen in Zusammenarbeit mit Sammlungen und Instituten der Humboldt-Universität und anderen Universitäten, Museen, Stiftungen, Theater- und Musikensembles und vielen anderen Akteur_innen. Die Projekte werden größtenteils durch das Helmholtz-Zentrums für Kulturtechnik initiiert und durchgeführt, ebenso können Initiativen von anderen Einrichtungen, freien Kurator_innen, Gestalter_innen und Künstler_innen nach Entscheidung durch den Programmrat gemeinsam weiter entwickelt und umgesetzt werden.