Deborah Zehnder studierte Kulturwissenschaft, Politikwissenschaft und Neuere und Neueste Geschichte an der Humboldt-Universität zu Berlin. Als Koordinatorin begleitete sie Drittmittel- und Forschungsprojekte am Institut für Kulturwissenschaft der Humboldt-Universität zu Berlin, als Produktionsleitung war sie für Theater- und Tanzkompanien und Festivals tätig. 2010 übernahm sie die wissenschaftliche Koordination der Antragsstellung für das Interdisziplinäre Labor, im November 2012 die wissenschaftliche Geschäftsführung des Exzellenzclusters. Von Januar 2015 bis August 2016 war sie Geschäftsführerin des Hermann von Helmholtz-Zentrums für Kulturtechnik.